Je viens de découvrir un très bon service sur google :
ça s'appelle Google Transit et ca marche super bien pour se déplacer au Japon.
Voici un test sur un calcul d'un trajet Tokyo Osaka
C'est vraiment super intéressant pour organiser un voyage !
cela dit, dommage qu'on ne puisse pas faire de réservation, mais bon en arrivant pas trop en retard a la gare de départ, et avec un peut de chance, ça doit pouvoir se faire !